2009年11月2日，内地与澳门科技合作委员会第三次会议在北京召开。科学技术部副部长曹健林、澳门特别行政区运输工务司司长刘仕尧出席会议并致辞。两地科技合作委员会委员以及相关机构的代表近60人参加会议。
会议回顾和总结了内地与澳门科技合作委员会第二次会议以来两地科技合作与交流发展状况，听取了各个工作组的进展汇报，对今后两地科技合作的工作重点和方向进行了讨论并达成了共识。委员们认为：一年多以来，两地科技合作与交流取得了较大发展。具体体现在以下几个方面：在节能环保等科技领域的合作不断深入；在推动澳门科普教育和展览等工作中效果显著；完成首批澳门专家入选国家科技计划专家库工作；逐步推进在澳门建设国家重点实验室伙伴实验室的工作等。此外，在两地科技合作委员会的框架下，粤澳等区域创新合作也取得积极进展。
委员们经过讨论后一致认为，新形势下有必要进一步发展和扩大内地与澳门的科技交流与合作。未来一年将推动澳门科研机构及人员参与国家重大科技计划；继续推动在澳门建立国家重点实验室伙伴实验室工作；两地合作培养葡语科技管理人员；加强粤澳的区域创新体系建设以及在中医药、节能环保、电子信息等双方共同感兴趣领域的合作。同时，两地政府将继续支持内地与澳门开展各种形式的科技交流与合作。
科学技术部曹健林副部长在会议中指出，澳门的科技发展是国家科技总体发展的有机组成部分，两地的科技合作对于繁荣两地经济、建设创新型国家具有非常重要的意义；两地科技界只有通过加强科技合作，共同提高科技创新能力，才能在促进产业升级，抵御经济风险方面有所作为。希望在本次会议后，进一步加强两地科技合作委员会工作层面的协商与沟通，并不断探索新的合作方式和领域，推动内地与澳门的科技合作迈上新的台阶，为繁荣两地经济和加速建设创新型国家做出新的更大贡献。
澳门特别行政区运输工务司司长刘仕尧在会议中指出，内地与澳门科技合作委员会的设立对促进澳门科技发展发挥了重要作用。自签署协议以来，委员会已经召开了两次会议，联络办公室及四个工作组开展了一系列卓有成效的工作，双方已经建立了坚实的合作基础。希望内地与澳门在现有的良好基础上，进一步加强合作和交流，切实促进两地科技及产业的发展。
2005年10月6日，科技部与澳门特别行政区科技委员会签署了《内地与澳门成立科技合作委员会协议》，共同成立“内地与澳门科技合作委员会”。该委员会成立后，负责统筹和协调内地与澳门的科技交流与合作。委员会成员由科学技术部、工业信息化部、环境保护部、卫生部、国务院港澳事务办公室、中央驻澳联络办、中科院、国家自然基金委、中国科学技术协会、广东省、珠海市等内地单位，以及澳门特别行政区政府运输工务司、澳门科技发展基金等相关澳门科技部门和机构组成。委员会主席分别由科学技术部分管副部长和澳门特别行政区运输工务司司长担任。
“内地与澳门科技合作委员会”内地成员单位科技部港澳台办公室副主任叶冬柏、政策法规司副司长李普、基础司副司长廖小罕、高新司副巡视员杨咸武、社发司副司长杨哲、交流中心主任孙洪、交流中心副主任赫文平、中央人民政府驻澳门联络办公室经济部副部长高尚德、工业和信息化部科技司副司长韩俊、中科院港澳台办主任张兴根、国家自然基金委合作局副局长王逸、中国科协联络部副部长李秀亭，以及卫生部、上海市科委、广东省科技厅、珠海市政府等部门的代表参加了本次会议。
