农药可分为杀菌剂、除草剂和杀虫剂。
由化学组成可分为有机氯农药、有机磷农药、氨基甲酸酯、含氮除草剂、苯氧羧酸除草剂等。各种农药使用后残留存在于土壤、水、植物体中，对不易降解的农药，经食物链会在人体中聚集，从而造成对人体健康的危害。
有机氯农药在20世纪 50-60 年代的广泛使用已造成对人类居住环境的严重危害，现已禁用。图6-4-65 为使用正向分配色谱柱，对有机氯农药的分离谱图。色谱柱为Micro Pak载体涂渍33% β，（φ2.4mm×500mm），流动相为异辛烷，流量0.5mL/min，用UVD（254nm）检测。
有机磷农药施用后，受热会分解，残留物危害较小，但其自身有强毒性和恶臭味，施用过程会对人畜造成伤害。图 6-4-66 为有机磷农药的分离谱图。色谱柱为Lichrosorb RP - 18（5μm，φ0.7mm×200mm，微填充毛细管柱），流动相为F’5甲醇水溶液，流量为40μL/min。色谱柱后流出液经一石英毛细管接口加热至300℃，用N2气喷雾，溶剂挥发后，样品被N2气带入热离子检测器检测（也可用蒸发激光散射检测器检测），对磷的zui小检出量为0.2-0.5pg/s。
氨基甲酸酯类农药具有、低毒的特点。图6-4-67为氨基甲酸酯类农药的反相键合相色谱分离谱图。色谱柱为μ - Bondapak C18（10μm，φ4mm×300mm），流动相为20%乙腈水溶液，进样后20-60min 使流动相中乙腈含量增至60%，并保持至80min，检测器为UVD（220nm），实现 23 种组分的分离。此类农药还可用电化学检测器检测。
