蓝景科信DAP-seq（DNA亲和纯化测序）技术服务实验分析流程
100+物种，1000+转录因子的实战经验。
无需抗体，高通量鉴定转录因子的下游基因，蓝景科信已助力客户在许多期刊发表文章，例如：Molecular Plant，The Plant Cell，Plant Physiology等。
蓝景科信DAP-seq（DNA亲和纯化测序）技术服务实验分析流程
在功能基因组学和表观遗传学研究中，转录因子结合位点（TFBS）的发掘一直是研究热点。传统的ChIP-seq（染色质免疫共沉淀测序）方法，在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。然而，好的抗体可遇不可求，这限制了ChIP-seq更广泛的应用。
DAP-seq技术的出现，使TFBS 的研究不再局限于物种，不再受抗体质量的限制，为生命科学领域转录因子的研究提供了新的有效工具。
DAP-seq与ChIP-seq技术对比
| 技术名称 | DAP-seq | ChIP-seq |
| 实验模式 | 体外 | 体内 |
| 是否需要特异性抗体 | 否 | 是 |
| 是否适用于非模式物种 | 是 | 否 |
| 时间成本 | 低 | 高 |
| 是否高通量 | 是 | 否 |
| 服务项目 | 周期 | 交付结果 | 报价 |
| 蛋白表达载体构建 | 1-2周 | 构建载体的测序结果 实验过程图 原始测序数据 分析结果 | 详细报价请电询 |
| 蛋白无细胞表达 | 1-2周 | ||
| DAP-seq文库构建 | 1周 | ||
| DNA亲和纯化 | 1-2周 | ||
| 上机测序 | 2周 | ||
| 标准数据分析 | 2周 |
| 已做物种 | ||||||||
| 植物 | ||||||||
| 拟南芥 | 茎瘤芥 | 甘蓝型油菜 | 白菜型油菜 | 不结球白菜 | 菜心 | 小麦 | 大麦 | 花生 |
| 辣椒 | 番茄 | 草莓 | 黄花棘豆 | 苦荞 | 红薯 | 木薯 | 马铃薯 | 普通烟草 |
| 人参 | 鸭茅 | ying su | 甘蔗 | 短芒大麦草 | 二色补血草 | 烟草 | 百脉根 | 芍药 |
| 丹参 | 狗尾草 | 菠菜 | 玉米 | 大豆 | 高粱 | 藜麦 | 陆地棉 | 甜瓜 |
| 黄瓜 | 葡萄 | 灰毡毛忍冬 | 粉葛 | 三叶青 | 猕猴桃 | 香蕉 | 蒺藜苜蓿 | 紫花苜蓿 |
| 伴矿景天 | 苔藓 | 地钱 | 毛果杨 | 717杨 | 84K杨 | 小黑杨 | 胡杨 | 山新杨 |
| 小叶杨 | 欧美杨 | 大青杨 | 毛白杨 | 刚毛柽柳 | 白桦 | 光皮桦 | 油松 | 毛竹 |
| 麻竹 | 银杏 | 油桐 | 荔枝 | 柑橘 | 甜橙 | 欧洲云杉 | 核桃 | 柿子 |
| 闽楠 | 木荷 | 脐橙 | 板栗 | 枣 | 枳 | 杜梨 | 苹果 | 桃 |
| 樱桃 | 麻疯树 | 茶树 | 梅 | 月季 | 海岛棉 | |||
| 动物 | ||||||||
| 驴 | 飞蝗 | 新孢子虫 | ||||||
| 真菌 | ||||||||
| 拟轮枝镰孢菌 | 猪苓真菌 | 意大利青霉 | 草酸青霉 | 腐霉 | 金黄壳囊孢 | 灵芝 | 糙皮侧耳 | 草菇 |
| 灰盖鬼伞 | 虫草 | 亚洲镰刀菌 | ||||||
| 细菌 | ||||||||
| 路德维希肠杆菌 | 嗜热厌氧杆菌 | 生氮假单胞菌 | 伯克赫尔德氏菌 | 布鲁氏菌 | 肺炎克雷伯菌 | |||
合作案例：
Wang L, Yao J, Wu N, Ahmad B, Nocker S, Wu JY, Abudureheman R, Li Z, Wang XP. Control of ovule development in Vitis vinifera by VvMADS28 and interacting genes. Horticulture Research. 2023. doi: 10.1093/hr/uhad070. (IF=7.291)
Wang L, Tian T, Liang J, Li R, Xin X, Qi Y, Zhou Y, Fan Q, Ning G, Becana M, Duanmu D. A transcription factor of the NAC family regulates nitrate-induced legume nodule senescence. New Phytol. 2023 Mar 22. doi: 10.1111/nph.18896. (IF=10.323)
Sun Y, Han Y, Sheng K, Yang P, Cao Y, Li H, Zhu QH, Chen J, Zhu S, Zhao T. Single-cell transcriptomic analysis reveals the developmental trajectory and transcriptional regulatory networks of pigment glands in Gossypium bickii. Mol Plant. 2023. doi: 10.1016/j.molp.2023.02.005. (IF=21.949)
Liu Y, Liu Q, Li X, Zhang Z, Ai S, Liu C, Ma F, Li C. MdERF114 enhances the resistance of apple roots to Fusarium solani by regulating the transcription of MdPRX63. Plant Physiol. 2023. doi: 10.1093/plphys/kiad057. (IF=8.005)
Liu YN, Wu FY, Tian RY, Shi YX, Xu ZQ, Liu JY, Huang J, Xue FF, Liu BY, Liu GQ. The bHLH-zip transcription factor SREBP regulates triterpenoid and lipid metabolisms in the medicinal fungus Ganoderma lingzhi. Commun Biol. 2023. doi: 10.1038/s42003-022-04154-6. (IF=6.548)
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Tang N, Cao Z, Yang C, Ran D, Wu P, Gao H, He N, Liu G, Chen Z. A R2R3-MYB transcriptional activator LmMYB15 regulates chlorogenic acid biosynthesis and phenylpropanoid metabolism in Lonicera macranthoides. Plant Sci. 2021. 308: 110924. doi: 10.1016/j.plantsci.2021.110924. (IF=5.363)
Liang S, Gao X, Wang Y, Zhang H, Yin K, Chen S, Zhang M, Zhao R. Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling. Biochem Biophys Res Commun. 2020. 526: 1100-1105. doi: 10.1016/j.bbrc.2020.04.011. (IF=3.322)
Yao J, Shen Z, Zhang Y, Wu X, Wang J, Sa G, Zhang Y, Zhang H, Deng C, Liu J, Hou S, Zhang Y, Zhang Y, Zhao N, Deng S, Lin S, Zhao R, Chen S. Populus euphratica WRKY1 binds the promoter of H+-ATPase gene to enhance gene expression and salt tolerance. J Exp Bot. 2020. 71: 1527-1539. doi: 10.1093/jxb/erz493. (IF=5.36)
蓝景科信DAP-seq（DNA亲和纯化测序）技术服务实验分析流程
其他服务：
NGS测序服务：微生物多样性测序、RNA-seq、被子植物353个单拷贝核基因靶向捕获测序
生物分子互作：DAP-seq、ChIP-seq，ATAC-seq，酵母单杂服务，EMSA，DNA Pull Down，Halo/GST pull down
蛋白表达：有原核/真核无细胞，大肠杆菌，酵母，昆虫细胞，哺乳细胞5种蛋白表达系统可供选择
DAP-seq是基于DNA亲和纯化，通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术，具有不受抗体和物种限制，且高通量的优势，自该技术问世以来，已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。能帮助您快速找到转录因子的结合位点，寻找转录因子调控的靶基因。
