测土配方施肥仪的使用不仅仅帮助农户合理的使用肥料，节省开支，更为保护土壤环境与生态平衡作出了巨大的贡献。水稻的测土配方施肥对土壤养分进行基本分析，然后确定使用肥料的种类、数量、搭配、时间等待，包括有施肥种类、施肥时间、 施肥量施肥方法、养分配比等。
在进行水稻配方施肥的同时，要结合有机肥施用，水稻配方施肥一般是指化肥特别是氮、磷钾肥的配方施用，因此决不能把配方施肥当作水稻生产上的的施肥方式，水稻生长中需要的养分是多种多样的，有大量元素、中量元素，也有微量元素，除配方施肥提供的养分外，其它养分还得靠有机肥或其它施肥方式来获得。
在使用多参数测土配方施肥仪的同时，配合施用有机肥，在释放出氮、磷钾等养分的同时，一些微量元素也依赖于有机质解释放出来；二是有机肥能改善土壤结构，解决土壤中水和空气之间的矛盾，提高肥料利用率；三是有机肥提供了土壤微生物繁殖需要的碳源，创造适宜微生物旺盛活动的土壤环境，因此能保证水稻持续高产稳。
在根据水稻产量目标和土壤养分状况进行配方施肥的同时，一定要注意根据水稻各个生育的吸收特点进行施用。在水稻整个生长过程中, 对氮、磷钾的需求和吸收状况总趋势是生长早期和后期吸肥较少，中期吸肥较多。在配方施肥上特别要注意水稻营养的临界期(幼苗期)和大效率期(伸长期)的施用。
