根的生长发育是植物生长的重要特点，并影响陆地生态系统和生物地球化学循环过程。观察根系的形态特征对于了解植物在自然生态系统中的表现，以及解释陆地生态系统的水分、碳和营养物质的动态迁移过程有着重要的作用。以往，对于植物根系形态特征的分析多是由人工测量，而现在随着科学技术的不断进步，工作人员可直接使用植物根系分析系统来实现根系形态指标的自动分析。
植物根系分析系统可检验根尖数、根系长度、平均直径、投影面积、表面积、体积、数量、连接数、长度、各级侧根的长度总和、平均直径、各级侧根的表面积总和、体积总和、投影面积总和等，可进行大批量分析，打开多张根系图片，可自动进行分析相关数据，可手工校正分析结果，保证检测数据的准确性。
在生活实践上，通过采取有效的技术措施能够培养出来健壮、适合的地下系统，从而以促进地上部健壮生长，可以为实现作物高产、优良奠定坚实基础。而整个过程需要研究根总长、根平均直径、根面积、根尖计数等重要的研究信息，在过去都需要人工进行，误差也在所难免。而根系扫描仪却可将这些困难都解决，只需要将植物根系洗干净，就能利用该仪器进行扫描分析。
运用植物根系分析系统掌握绿色植物根系构造，更容易掌握植物根系吸收水分、养分特性，从而为不同类型的农田、草地林地等选择适宜的灌水时期和灌水方式提供可靠的数据参考，以此提升水分利用率，实现节水灌溉。
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