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脓毒症大鼠脾组织的涡旋振荡器应用及分析

阅读:121发布时间:2021-11-8

材料与方法


低温离心机( Eppendorf) ,涡旋振荡器( 海门其林贝尔) ,TissueLyser II 85300[QIAGEN,BGISEQ-500( 华大基因) ],Agilent 2100 Bioanalyzer( Invitrogen) ,紫外分光光度计( NanoDropTM) 。清瘟败毒饮全成分每剂含生石膏 15 g、生地黄 7. 5 g、水牛角 15 g、黄连2. 5 g、栀子5 g、桔梗5 g、黄芩5g、知母 5 g、赤芍 5 g、玄参 5 g、连翘 5 g、甘草 5 g、丹皮 5 g、竹叶 5 g,每剂用蒸馏水 60 ml 溶解即每 ml 含生药 1. 5 g。 Trizol 试剂( Invitrogen) ,去离子水 ( Ambion) ,、异戊醇、异丙醇( 均为西陇化工) 。各组脾组织标本提取总 RNA 后,用带有Oligo( dT) 的磁珠富集 mRNA,并于提取到的 mRNA 中加入Fragmentation Buffer 使其片断成为短片段,再 以 片 断 后 的mRNA 为模板,用六碱基随机引物( random hexamers) 合成cDNA 链,并加入缓冲液、dNTPs、RNase H 和 DNA polymerase I 合成 cDNA 第二链,经过 QiaQuick PCR 试剂盒纯化并加 EB 缓冲液洗脱经末端修复、加碱基 A,加测序接头,再经琼脂糖凝胶电泳回收目的大小片段,并进行 PCR 扩增,从而完成整个文库制备工作,构建好的文库用 BGISEQ-500 进行测序。

旋涡混合器VORTEX-5


结果


A、B 组大鼠脾组织 TNF 信号通路相关差异基因表达比较,两组同时上调的基因有 19 个,同时下调的基因有 8 个,下调转正常的基因有 1 个,正常转上调的基因有 5 个,上调转为正常基因有 7 个,正常转下调基因有 13 个。脓毒症是一种由感染引起的复杂免疫系统紊乱,常危及患者生命。目前,传统的广谱抗感染联合脏器支持治疗费用高昂,给个人及社会造成巨大的医疗负担。相对于西医药治疗,中医中药如对该病治疗具有效果,则更具有效益比。相关研究显示,脓毒症早期予以中药干预治疗可预防脓毒症相关性胃肠道疾病,有利于减少机械通气时间及病死率。






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