电磁流量汁运行中产生故障首先为仪表本身故障，即仪表结构件或元器件损坏引起的故障；第二类为外界原因引起的故障，如安装不妥流动畸变，沉积和结垢等。按照故障发生时期分类，可分为：1.调试期故障；2.运行期故障。调试期故障出现在新装用后调试初期，主要原因是仪表选用或设定不当，安装不妥等。运行期故障足在运行一段时期后出现，主要原因有流体中杂质附着电极衬里，环境条件变化出现新干扰源等。按故障外界源头分析来自3个方面：1.管道系统和安装等方面引起的；2.环境方面引起的；3.流体方面引起的。
电磁流量计测量含有悬浮固相或污脏体的机会远比其他流量仪表多，出现内壁附着层产生的故障概率也就相对较高。若附着层电导率与液体电导率相近，仪表还能正常输出信号，只是改变流通面积，形成测量误差的隐性故障；若是高电导率附着层，电极间电动势将被短路；若是绝缘性附着层，红外测温仪电极表面被绝缘而断开测量电路。后两种现象均会使仪表无法工作。
雷电击在线路中感应瞬时高电压和浪涌电流，进入仪表就会损坏仪表。雷电击损仪表有3条引入途径：电源线，传感器勺转换器间的流量信号线和激磁线。然而从雷电故障中损坏零部件的分析，引起故障的感应高电压和浪涌电流大部分足从控制室电源线路引入的，其他两条途径较少。还从发生雷击事故现场了解到，不仅电磁流量计出现故障，控制室中其他仪表电常常同时出现雷击事故。因此使用单位要认识设置控制室仪表电源线防雷设施的重要性。
环境条件变化引起的故障干扰源不在调试期出现而在运行期间再介入的。例如一台接地保护并不理想的电磁流量计，调试期因无厂扰源，仪表运行正常，然而在运行期出现新干扰源（例如测量点附近管道或较远处实施管道电焊）干扰仪表正常运行，出现输出信号大幅度波动。
电磁流量计规仪器检查：1）电阻法：1.保险丝的通断；2.信号电缆、激磁电缆的通断；3.激磁线圈的通断；4.电极对称性测量；5.电极对地的绝缘电阻；6.激磁线圈对地的绝缘电阻。2）电流法：1.测量激磁电流；2.测量输出电流。3）电压法：判别：工作电源（包括供电和转换器本身电源）是否正确。4）波形法：在熟悉线路基础上测量关键点波形，判别故障所在。5）替代法：利用转换器和传感器间以及转换器内务线路板部件间的互换性，以替代法判别故障所在位置。6）信号踪迹法：用模拟信号器替代传感器，在液体未流动条件下提供流量信号，以测试电磁流量转换器。
检查电磁流量计工作是否正常，逆流量信号传送的方向进行。用模拟信号器测试转换器，以判断故障发生在转换器及其后位仪表还足在转换器的上位传感器发生的。若足转换器故障，如有条件可方便地借用转换器或转换器内线路板作替代法调试；若是传感器故障需要试调换时，因必须停止运行，关闭管道系统，因涉及面广，常不易办到。特别是大口径流量传感器，试换工程量大，通常只有在作完其他各项检查，后才下决心，卸下管道检查传感器测量管内部状况或调换。
