当然会有影响的，紫外线的杀菌力比较强，但是穿透力极弱，罩个2毫米厚的塑料灯罩就几乎没有杀菌力了！所谓紫外线就是指波长较“可见光"（可见光的波长大约在400—700微米之间）短的“非可见光线"等等，由于波长短，所携带的能量高，就容易对人体的组织产生直接或者间接的伤害。
依据波长又会将紫外线分为UV—A，UV—B及UV—C三种，紫外线灯管波长愈短能量愈高，相反的就是波长愈长穿透力愈好。地球因为会有臭气层保护，所以阳光里面的紫外线大约只有5%进入大气层内，其中90%为UV—A，10%为UV—B，幸运的是大部分UV—C都会被臭氧层所吸收。
UV—C（小于280微米），由于能量高但是穿透力低，会造成眼角膜表皮的灼伤。大部分都是来自人造光源，如电焊、紫外线杀菌灯、雷射，所以在使用这几类光源的时候要特别注意眼睛的保护。
UV—B（280—320微米），就会造成眼睛各式各样的伤害，来源以阳光居多，尤其是以在雪地、沙滩、泳池嬉戏时，也会因为阳光的反射，来造成更严重的破坏。水晶体当其衡，容易导致白内障的形成，结膜结缔组织会会增生，产生翼状赘肉，眼皮的皮肤从而也会因为曝晒造成角质增生，甚至转变为皮肤癌，此外也有可能加速老花眼的形成。
UV—A（320—400微米），由于穿透力强，会容易形成眼睛深部视网膜的伤害，比如像老年性黄斑部病变，以及加速视网膜色素细胞炎的患者感光细胞的退化。
紫外线灯管是以天然水晶为材料之纯石英玻璃管所制造，纯石英管的紫外线的穿透率高于80%。但是紫外线的穿透能力并不如想象中之高，任何纸片、铅玻璃、塑料都会大幅减地降低照射强度。因此石英外壳上面的秽物、油渍都会直接影响其穿透的能力。所以新灯管在使用之前，应用沾着75%酒精的纱布擦拭，清除油渍、手汗及灰尘。使用中的灯管、石英外壳应该定期擦拭清洁，以免会影响到紫外线穿透率及照射强度。
紫外线杀菌灯管也会有一定的使用寿命，由于紫外线的强度无法用肉眼来判定，是否仍然会有杀菌能力，是无法作出检测及无法掌握。连续使用也就只能维持六个月至一年的期限，一超过时限，紫外线就不能穿透石英外壳而发挥消毒效果，必须更新才行。
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