石英亚沸蒸馏水器在蒸馏一段时间后，水垢就骤在横式烧瓶内及加热管表面上，这时必需要进行清洗，清洗的次数主要视自来水的硬度和使用时间而定，如仪器长时间不进行清洗，要影响蒸馏效果，严峻的要损坏加热管，并清洗时间要延长。

清洗步骤：

　　1. 堵截电源，关上自来水。

　　2. 加入浓盐酸100毫升到横式烧瓶内，与瓶内的水释盐酸，如积垢教多盐酸可多放点，数分钟后由水位器放出，后用自来水冲刷数次，为了清除微量盐酸，可将烧瓶前后摇动，使不宜清洗的死角冲刷干净为止。

　　3.当再次蒸馏时，开始10分钟内所蒸馏的水，舍去不用。

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