蒸馏水器按照制作材质进行区分：不锈钢蒸馏水器和玻璃蒸馏水器二种

不锈钢蒸馏水器有普通不锈钢蒸馏水器和塔式蒸馏水器。一般蒸馏水器就是传统的不锈钢蒸馏水器。塔式的一般要连接锅炉利用锅炉的蒸汽来制蒸馏水，一般体型也较大，出水量是很大的。

石英玻璃蒸馏水器可分为普通的玻璃蒸馏水器（一般只有蒸发锅是石英的），和石英（亚沸）蒸馏水器，石英（亚沸）蒸馏水器是利用红外线辐射的，在低于水的沸点的情况下使水蒸发的，可以避免传统电热加热煮沸使水蒸汽中含有其他杂质，也可避免与水共沸的杂质混入成水中。但是石英蒸馏水器由于材质问题易碎且体型较小，红外线加热缓慢，因此其产水量不是很高，一般亚沸的Z多的1500ML/H。因此产出水水质比普通不锈钢蒸馏器要高很多。