上海谷研实业有限公司
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阅读:74发布时间:2018-01-18
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1、 虾白尾病(WTD)荧光 RT-PCR 检测试剂盒(MrNV)简介
货号:HB-810-1
虾白尾病(White tail disease,WTD)也称为白肌肉病(White muscle disease,WMD)或罗
氏沼虾肌肉白浊病(Macrobrachium rosenbergii Whitish muscle disease),主要在亚洲和南美洲北部流行。其主要病原为罗氏沼虾野田村病毒(Macrobrachium rosenbergii Nodavirus,MrNV),
研究发现感染对虾中还存在另外一种超小型病毒(Extra small virus,XSV),为 MrNV 的微型病毒。
虾感染后腹部、尾部出现白色浑浊,zui终可扩散全身肌肉,死亡率可达 95%以上。
为了适应虾白尾病快速检测和疫病研究的需要,本公司参考 2016 年 OIE 水生动物疾病诊断手册
2.2.7 中*的的引物和探针序列,经多次实验及系统优化,开发生产了本试剂盒。应用本试剂盒
进行检测具有快速、灵敏、特异、准确、安全操作简单、应用广泛和高通量检测等特点及优点。
2、 试剂盒组成
试剂盒组成包括核酸扩增试剂。具体组成参见表 1:
表 1:试剂盒组成(50test/盒)
试剂盒组成成分 体积
*: 核酸裂解液 15ml×2 管
核酸扩增试剂: DEPC 水
WTD-MrNV 荧光 RT-PCR 反应液
酶混合物
阴性对照
WTD-MrNV 荧光阳性对照
1ml×1 管
750µL×1 管
60µL×1 管
1ml×1 管
1ml×1 管
(注:*可使用本公司生产的提取核酸更快捷方便的《病毒 RNA 柱式提取试剂盒》)
3、 样本采集,存放及运输
3.1 样本采集:所用取样器材必须经高压灭菌并烘干。随机取5只-10只新鲜的虾作为采样标本,采
集的部位包括:虾头部的眼柄、肝胰腺、头腹部肌肉或腹肢等(可部分或全部采集这些组织)。详
见相关标准。
3.2 存放:研磨后的样本在 2 ℃—8 ℃条件下保存应不超过 24 h;-70 ℃以下可*保存,但应避
免反复冻融(zui多冻融 3 次)。
3.3 运输:采用泡沫箱加冰密封进行运输。
4、 荧光 RT-PCR 检测
4.1 操作方法
4.1.1 样本的处理(在样本制备区进行):
4.1.1.1 取 n 个灭菌的 1.5 mL Eppendorf 管,其中 n 为被检样品与阴性对照的和(阳性对照、阴性对照在试剂盒中已标出),做标记。(注:试剂盒中的阳性对照直接作为 PCR 检测的模板,无需
提取核酸)
4.1.1.2 虾白尾病(WTD)荧光 RT-PCR 检测试剂盒(MrNV)每管加入 600 L 裂解液,分别加入被检样本和阴性对照各 200 L,一份样本换用一个吸头,混匀器上振荡混匀 5 s(不能过于强烈,以免产生乳化层,也可以用
手颠倒混匀),于 4℃ 12 000 r/min 离心 15 min。
4.1.1.3 取与 4.1.1.1 相同数量灭菌的 1.5 mL Eppendorf 管,加入 500 L 异丙醇(-20℃预冷),做标记。吸取 4.1.1.2 各管中的上清液转移至相应的管中,上清液应至少吸取 500L,不能吸出中间层,颠倒混匀。
4.1.1.4 于 4 ℃、12 000 r/min 离心 15 min(Eppendorf 管开口保持朝离心机转轴方向放置),小心倒去上清,倒置于吸水纸上,沾干液体(不同样品须在吸水纸不同地方沾干);加入 600 L 75%
乙醇,颠倒洗涤。
4.1.1.5 于 4 ℃、12 000 r/min 离心 10 min(Eppendorf 管开口保持朝离心机转轴方向放置),小心倒去上清,倒置于吸水纸上,尽量沾干液体(不同样品须在吸水纸不同地方沾干)。
4.1.1.6 4 000 r/min 离心 10s(Eppendorf 管开口保持朝离心机转轴方向放置),将管壁上的残余液体甩到管底部,小心倒去上清,用微量加样器将其吸干,一份样本换用一个吸头,吸头不要
碰到有沉淀一面,室温干燥 3 min,不能过于干燥,以免 RNA 不溶。
4.1.1.7 加入 11 L DEPC 水,轻轻混匀,溶解管壁上的 RNA,2 000 r/min 离心 5 s,冰上保存备用。提取的 RNA 须在 2 h 内进行 PCR 扩增;若需*保存须放置-70 ℃冰箱内。
【也可参照《病毒 RNA 柱式提取试剂盒说明书》(货号:HB-QPCR-01)使用,更方便快捷提取
核酸】。
注:提取的 RNA 须在 2 h 内进行 PCR 扩增;若需*保存须放置-70 ℃冰箱内。
4.1.2 检测
4.1.2.1 扩增试剂准备(在反应混合物配制区进行):
从试剂盒中取出相应的荧光 RT-PCR 反应液、酶混合物,在室温下融化后,2000 r/min 离心 5 s。
设所需荧光 RT-PCR 检测总数为 n,其中 n 为被检样品、阳性对照与阴性对照的和,每个样品测试反应体系配制见表 2:
表 2 每个样品测试反应体系配制表
试剂 RT-PCR 反应液 酶混合物
用量 15 μL 1.0 μL
根据测试样品的数量计算好各试剂的使用量,加入到适当体积试管中,充分混合均匀,向每个
荧光RT-PCR管中各分装16 L,转移至样本处理区。
4.1.2.2 加样(样本处理区进行):
在各设定的荧光RT-PCR管中分别加入上述样本处理步骤4.1.1.7中制备的RNA溶液各10 L,盖紧
管盖,500 r/min离心30 s。
4.1.2.3 荧光 RT-PCR 检测(在检测区进行):
将4.1.2.2中离心后的PCR管放入荧光RT-PCR检测仪内,记录样本摆放顺序。
虾白尾病(WTD)荧光 RT-PCR 检测试剂盒(MrNV)循环条件设置:
*阶段:42oC /60 min;
第二阶段:95oC /10 min;
第三阶段:95oC /15 sec, 58 oC /30 sec,40个循环,在58 oC的退火延伸时收集荧光。
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