一、样品 DNA 的制备
1.用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒 DNA 提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的柱式病毒 DNAout。
二、引物的制备(在样品制备室进行)
2.按引物标签提示在装引物干粉的管中直接加入适量的超纯水(加入量见引物试管上的标签),使得两条引物的浓度均为 10 μM(10 pmol/μL),然后各取 50 μL混合在一起,标注为引物混合物,放冰上待用。
三、稀释阳性对照(以 10E2-10E7 这 6 个 10 倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,
因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成
分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,
猴B疱疹病毒荧光定量 PCR 检测试剂盒(染料法)
Herpesvirus simiae qPCR Kit(Dye based) CAT#:11-180703
只提供可以直接使用的长为 124bp 的 DNA 段作为阳性对照。3. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
4.用带芯枪头分别加入 45 μL 超纯水(用带芯枪头,下同)。
5.先将本试剂盒提供的阳性对照用超纯水 10 倍梯度稀释到 10E8 拷贝/μL。放冰上待用。
6.在 7 号管中加入 5 μL 10E8 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 10E7 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
7.换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1 分钟,得 10E6 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
8.换枪头,从 6 号管中取 5 μL 溶液到 5 号管中,充分震荡 1 分钟,得 10E5 拷贝/ μL 的阳性对照。放冰上待用。
9.换枪头,从 5 号管中取 5 μL 溶液到 4 号管中,得 10E4 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
三、设置 PCR 反应(20 μL 体系,在样品制备室进行)
10.在 PCR 管中加入下列成分(待测样品需要做三次重复,下表只列出一次。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后后加):
成分 样品 阴性对照 阳性对照(2-7 管)
2×qPCR Mix 10 μL 10 μL 各 10 μL
引物混合物 2 μL 2 μL 各 2 μL自备 10×ROX (见注) 2 μL 2 μL 各 2 μL
待测样品 DNA 模板 1-5 μL 不加 不加
各 5μL(2 号样到阳性对照(2-7 号) 不加 不加 2 号管,3 号样到 3
号管…)
补水到 20 μL 20 μL 20 μL
注:仅 ABI7500、7700 和 7900 仪器需要使用ROX 作为对照,其他荧光 PCR 仪器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480)不需要使用 ROX。
11.盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR(具体 PCR 参数可以根据仪器不同而自行
优化)。
过程 温度 时间
预变性 95℃ 5 分钟
PCR 反应
(40 个循环) 95℃ 15 秒
60℃ 60 秒
12.数据采集
具体操作按所用仪器推荐的流程进行。本产品中所含的荧光染料在不结合 DNA 时, 大吸收光谱在 471 nm,结合 DNA 时的大吸收光谱在 500 nm,大发射光谱在 530 nm。
四、数据处理
13.以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品
浓度的 log 和标准曲线计算出样品 DNA 的浓度。
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