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在发表的细胞株新研究论文中,Schreiber和Broad研究所的同事对这一门户进行了描述,指出其中包含的信息是通过测量240种癌细胞系对于超过350种靶向细胞回路不同节点的化合物的反应而获得。这些细胞系来自许多不同种类的肿瘤,另一项称作为癌细胞系百科全书(Cancer Cell Line Encyclopedia,CCLE)的互补研究已经确定了这些细胞系的基因组特征。在美国国家癌症研究所癌症靶点发现和开发(CTD2)项目的支持下,CTRP充分利用了CCLE的公共数据,其中包含了有关每个癌细胞系突变、基因表达和其他基因组改变的信息。
Schreiber说:“CTRP和CCLE两个项目显著不同但又*地互补。两者都是处于早期发展阶段。随着每个资源中数据的数量和多样性不断地增长,我们预计匹配患者与潜在有效药物的能力将会大大地提高。”
Schreiber和同事们证明,研究中的这组化合物可以用来发现癌细胞系从前未检测到的依赖性。随着正常细胞一步步地变为癌细胞,它会累积大量的促癌遗传改变,使得细胞能够不受控制地分裂和存活。此外,在癌症形成的过程中,其他通常在细胞中发挥无害作用的基因有可能变得对癌症生存至关重要。通过让细胞系暴露于不同的化合物中,研究人员能够揭示癌细胞生存所必需的蛋白质,并有可能提供新的治疗靶点。
Schreiber.说:“这些基因或许在癌症早期阶段没有发挥内在作用,但随着癌细胞形成,它会收编一些正常的蛋白质成为癌基因的伙伴。这就是我们真正想要揭露的:基因自身没有被癌症所改变,但却与癌基因结合到了一起。这一门户是揭示这些依赖性的一种好的途径。”
在他们的论文中,Schreiber和同事们描述了一个如何利用CTRP来发现候选依赖性的例子。研究小组发现一种在细胞株肺癌临床试验中测试的药物navitoclax,或许能够尤其有效地靶向带有CTNNB1突变的癌细胞系。CTNNB1突变存在于一些大肠癌、肝细胞癌、胃癌和子宫内膜癌中。这只是一个关于CTRP如何能够帮助揭示有用生物标记物的例子,利用生物标记物可以预测药物反应和耐药。除了发现已开发药物的新用途,CTRP还可用于鉴别新的治疗靶点。
雷尼替丁相关物质A标准品 91224-69-0 50mg
雷尼替丁相关物质B标准品 72126-78-4 50mg
雷尼替丁相关物质C标准品 73851-70-4 50mg
类姜黄素标准品 300mg Curcuminoids
利巴韦林标准品 36791-04-5 200mg Ribavirin
利多卡因标准品 137-58-6 250mg Lidocaine
利福布丁标准品 72559-06-9 50mg Rifabutin
利福平标准品 13292-46-1 300mg Rifampin
利福平醌标准品 13983-13-6 25mg Rifampin Quinone
利鲁唑标准品 1744-22-5 200mg Riluzole
利鲁唑相关物质A标准品 461-82-5 25mg Riluzole Related Compound A
利奈孕醇标准品 52-76-6 20mg Lynestrenol
利尿酸标准品 58-54-8 200mg Ethacrynic Acid
细胞株
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