如果液相色谱仪器的系统出现了故障说明这个液相色谱仪器系统的某些部位的性能偏离了仪器出厂设计指标，或者是系统由于各种原因停止工作，因为液相色谱仪器的系统指标不可能只有一项，有时候有很多项。每一项和其它项目指标都有着明确的联系，如果要证明液相色谱仪系统的好坏，我们必须要根据出厂指标或者国家有关部门规定的技术指标好试验方法进行检验。凡是不能够达到液相色谱仪出厂标准的或者国家技术规定的试验方法，都可以统称为仪器出现了故障。只不过这些故障有大，有小。对于使用它的人可能会出现不同的参数，我们在这里强调的是检测检验方法能够达到国家认可的。比方：国家有关部门规定液相色谱仪的检测的方法，鉴定规则。环境检测标准。有关国家标准和供应商提供的检验方法。
正常情况来说。液相色谱仪器的试验方法分为总则、主机性能试验、检测器性能试验和环境性能试验四章。在相关的试验方法中明确规定了液相色谱仪器系统的各项指标合格与否的判断依据与结论。在使用中还需注意由于用户与生产厂家的立场不间，对于一些可能的问题有时会有理解仁的分歧。
液相色谱仪器发生故障时需要进行检修或故障排除，检修人员要依照一定的程序对液相色谱仪器进行一系列诊断测试。该测试过程一直将延续到故障原因被发现;发现故障原因后.采取正确的故障排除措施。在诊断测试整个过程中，所有按次序排列的诊断语言的集合被称为故障诊断对策。
