1. 简单皮实。离子阱系统（包括3D离子阱和2D线性离子阱）通常都构造相对简单，没有像Orbit Trap所需要的C-Trap、Z-Lens等复杂的离子传输电镜；对工作环境要求不严苛，没有像TOF一样需要对环境温度和试验台震动有着近乎苛刻的要求。相比较QqQ系统需要至少三套独立射频RF系统来飞别控制三个四极杆，一台离子阱系统，通常只需要一组射频RF就足够。简单的构造带来的直接特点就是故障率低，皮实耐用。另一个由构造简单带来的特点是容易小型化，这也是为什么现在小型化质谱系统大多是基于离子阱技术的原因。2. 多极质谱。一般来说，多极质谱技术分为两种，Tandem-in-space空间多极质谱/Tandem-in-time时间多极质谱。对于分析复杂混合样品，多极质谱能很大程度去除背景干扰，增强信噪比，同时也能在需要解析离子结构的应用中起到很大的作用。