* 应对代谢物鉴定和确证，LTQ系列质谱可自动查找到所有可能的代谢物。

* 基于离子/离子化学的电子转移解离(ETD)，LTQ XL离子阱是实现此技术的zui*仪器。ETD与CID互为补充，提高蛋白序列覆盖率；保护不稳定PTM翻译后修饰基团，简化数据分析；单次进样自动启动CID和ETD。

* 母离子智能选择：自动数据依赖多级质谱采集技术不仅能为用户提供预测代谢物（母离子列表）结构信息，也能提供提供未预测的代谢物结构信息。此外，使用自动固定中性丢失数据依赖性（CNL)扫描触发三级质谱扫描能检测某一类的代谢物。使用MetWorks和MassFrontier分析软件增强复杂基质钟代谢物筛选和鉴别功能，使谱图解析更加简便。

* 应对蛋白质组学和生物标记问题，ETD解离技术使LTQ XL成为蛋白质组学研究更强大的分析工具。

* LTQ和LTQ XL质谱均可配置ETD裂解源，ETD能够为线性离子阱提供类似ECD（电子捕获解离）的裂解碎片，在生成大量肽段碎片的同时，保护不稳定的PTM翻译后修饰集团，例如磷酸化翻译后修饰。ETD功能与赛默飞世尔线性离子阱的高离子储存量相结合，是蛋白质和肽类分析的新型有效工具。