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荧光定量PCR是利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增中每一个循环扩增产物量的变化，并进行定量分析。我们通常使用染料法实现qPCR的实时监控，那么染料法如何实现qPCR的实时监控呢？
染料法就是在PCR反应体系中加入荧光基团，我们常用的染料就是SYBR Green Ⅰ这种染料。这种染料有以下特性：该染料可以非特异地结合在双链DNA小沟上，而不与单链结合。这里的非特异性是指，只要是双链DNA，它都能结合上去，不管该双链DNA是否是你期望扩增的目标基因还是非目标基因。这种染料在游离状态下几乎不会产生荧光，因此仪器也就没有反应，一旦染料结合了双链DNA就会产生较强的荧光信号，仪器也就有所反应。
那么，具体在扩增过程中。首先，在扩增的起始阶段，经过热变形双链DNA发生解链变成单链，染料结合不上去，因此就没有荧光信号。随着反应的进行，有双链形成之后，染料就会结合在双链形成的小沟上。每形成一个DNA双链，就有一定数量的染料结合上去；染料一结合，就产生荧光信号；信号强度与DNA分子总数目成正比。那么在PCR的每一个循环中这种荧光信号的积累过程就能被仪器所实时监控。
当然，由于SYBR Green Ⅰ是非特异性结合在双链上，所以一旦在PCR扩增过程中有非特异性产物的生成，它也会产生被仪器所检测到的荧光信号，这种非特异性的信号与特异性的信号由于无法区分就会导致实验结果的不准确性。
通常，为了保证我们实验结果的准确性。我们在做染料法时，通常都会做熔解曲线，来帮我们判断实验结果是否可靠。
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