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对于刚接触分子生物学实验的小伙伴们来说,如果做一些与基因相关的实验的话,肯定离不开最基础的实验——PCR,目前大家使用PCR技术做的最多的就是对基因/物种的鉴定、基因的克隆、基因表达量测定等实验。今天百奥创新将介绍PCR引物设计要遵循什么原则。
1、引物长度一般在15-30bp。常用的为18-27bp,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于Taq DNA聚合酶进行反应;
2、引物GC含量一般为40%-60%, 45-55%为宜,GC含量过高或过低都不利于引发反应,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近,一般Tm值不超过5℃。
3、引物所对应的模板序列的Tm值在55-80℃之间,最好为72℃左右。
4、引物的延伸是从3′端开始的,不能进行任何修饰,且 3’端的碱基一般不用A;引物3’端出现3个以上的连续碱基,如GGG或CCC,或者引物3’端的互补、二聚体或发夹结构也可能导致PCR反应失败,
5、碱基要随机分布,且引物自身和引物之间不能有连续4个碱基的互补。
6、尽量在基因的编码区(CDS序列)上设计引物,限制基因组DNA扩增。
7、使用BLAST检索,确认引物特异性。
以上就是有关于PCR引物设计要遵循什么原则的问题解答,如果你想了解更多请咨询百奥创新客服哦!
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