在水体中，富有植物一般都含有叶绿素a，因此利用叶绿素的荧光效应可以检测出水体中的植物生物量，但一般很难特异性地检测出蓝藻地含量。在内陆湖泊水华中，蓝藻是优势生长藻类，也是水华爆发地主导物种；同时蓝藻中藻蓝蛋白具有特征的645nm荧光谱。因此，利用叶绿素a和藻蓝蛋白的特征光谱可准确地检测出水体中的蓝藻浓度含量。蓝藻荧光传感的工作原理如下图所示。

在水体中，激发的叶绿素于藻蓝蛋白荧光强度于蓝藻的浓度也具有正比关系，下图是用上述传感器检测不同蓝藻浓度时的曲线，在较小的浓度范围内，传感器都能灵敏地测试出蓝藻含量，在0.1μg/L地浓度时，输出电压达到了3.4V。并且输出电压于蓝藻浓度具有很好的线性对应关系，期线性相关系数达到了0.99。通过调节传感器中可变增益地信号放大倍数，可以实现高浓度的蓝藻检测。

禹山蓝绿藻传感器是利用蓝藻在光谱中有吸收峰和发射峰这一特性，在蓝藻的光谱吸收峰发射单色光照射到水中，水中的蓝藻吸收单色光的能量，释放出另外一种波长发射峰的单色光，蓝藻发射的光强与水中蓝藻的含量成正比。该传感器安装简单使用方便。通过荧光分析法来监测蓝绿藻的含量。该方法直接检测蓝绿藻细胞中特定色素的荧光物质，以确定相对的藻类毒素。
蓝绿藻传感器的功能：
基于色素的荧光性测量目标参数的，可在潜在的水造成影响前进行识别；
数字化传感器，抗干扰的能力强，传输距离远；
传感器现场安装方便快捷，实现即插即用；在线连续监测，实时掌握水质动态；
可选自动清洁刷、防止沾污，清除水样中附着物；
可对藻类的繁殖起到预警作用；维护周期更长，长期在线使用也能保持稳定性。