PCR实验中的内标是指在反应体系中添加的一种非靶序列分子,用以监测整个PCR过程的准确性和有效性。内标的主要功能是帮助判断实验中是否发生了假阴性,即由于采样、提取或扩增过程中的问题导致目标基因未能正确扩增。
一、内标主要分为两种类型:
(1)内源性内标:这是指在样品中天然存在的基因,如GAPDH、18sRNA等持家基因。这些基因在各种组织和细胞中的表达相对恒定,因此可以作为内标来监控实验的各个环节。如果内源性内标“起线”,则表明实验过程可能存在问题,如采样不充分。但需要注意的是,内源性内标无法监测提取过程中的所有问题。
(2)外源性内标:这种内标是人工添加的,通常是一种不会干扰靶序列扩增的合成序列或假病毒,如MS2噬菌体。外源性内标可以更好地监控从核酸提取到扩增的全过程,尤其是当内源性内标无法覆盖检测时。如果外源性内标未“起线”,则可能表明核酸提取不足或反应体系中存在抑制物。
二、内标的作用
(1)内标的使用可以帮助研究人员判断实验过程中是否存在技术性失误,从而提高实验结果的可信度。
(2)内标的使用有助于减少假阴性的发生,确保实验结果的可靠性和准确性。通过观察内标的扩增曲线,研究人员可以判断实验是否存在问题,从而采取相应的措施来优化实验流程。
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