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转基因大豆EPSPS基因核酸检测试剂盒原则

时间:2022/1/28阅读:185
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PCR试剂盒原则:

1、引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。

2、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。

3、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

4、避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。

5、引物3'端的碱基,特别是末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。

6、引物中有或能加上合适的酶切位点, 被扩增的靶序列有适宜的酶切位点, 这对酶切分析或分子克隆很有好处。

7、引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性①引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。

8、引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。

9、引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

10、避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。

11、引物3'端的碱基,特别是末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。

12、引物中有或能加上合适的酶切位点, 被扩增的靶序列有适宜的酶切位点, 这对酶切分析或分子克隆很有好处。

13、引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性


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